U Homolju živi preko 140 ugroženih vrsta. Među njima je i treći najveći predator u Evropi: evroazijski ris, koji je na rubu istrebljenja.

Homolje je dom prelepog velikog plavog leptira (nalazi se na Crvenoj listi ugroženih vrsta Međunarodne unije za zaštitu prirode) i niza drugih izuzetnih vrsta. Homolje je dom vilinih konjica, veličanstvenog zlatnog orla, sivog vuka, mrkog medveda i mnogih drugih fascinantnih stvorenja.

Netaknute vode reka Tisnice, Crne Reke i Mlave čuvaju skriveno blago biodiverziteta. U njihovim dubinama nalze se kameni rak, razigrana rečna vidra i brojne vrste riba koje uspevaju samo u čistoj vodi i raznovrsnim ekosistemima.